Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms