Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VIRMAQ69YN4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VIRMAQ69YN4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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