Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLX4IPQ5VYV7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms