Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms