Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C10orf55Q5SWW7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms