Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SFT2D3Q587I9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms