Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms