Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CDO1Q16878 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CDO1Q16878 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDO1Q16878 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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