Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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