Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDK4Q16654 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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PDK4Q16654 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PDK4Q16654 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms