Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACKR1Q16570 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACKR1Q16570 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms