Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DDB1Q16531 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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DDB1Q16531 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDB1Q16531 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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