Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPE65Q16518 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms