Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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NCOA1Q15788 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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NCOA1Q15788 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCOA1Q15788 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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