Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms