Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
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