Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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