Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAM2Q15035 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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