Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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