Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNIQ14094 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms