Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL9A3Q14050 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL9A3Q14050 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms