Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TSTA3Q13630 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms