Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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