Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAMK2BQ13554 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms