Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF5Q13243 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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