Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms