Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
BPTFQ12830 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BPTFQ12830 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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