Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMARCB1Q12824 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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