Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A7Q0GE19 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms