Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms