Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RBBP4Q09028 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms