Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DSC1Q08554 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms