Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms