Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CALD1Q05682 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CALD1Q05682 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms