Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms