Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms