Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NUCB1Q02818 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms