Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SCN7AQ01118 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SCN7AQ01118 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms