Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAT1AQ00266 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms