Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKOR1P84550 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms