Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK2A1P68400 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms