Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HERVK_113P61574 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms