Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERFP50548 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERFP50548 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms