Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
POU3F4P49335 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms