Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA4P48169 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms