Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IQGAP1P46940 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IQGAP1P46940 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms