Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A2P43354 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NR4A2P43354 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms