Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV4P43268 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV4P43268 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ETV4P43268 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ETV4P43268 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ETV4P43268 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ETV4P43268 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV4P43268 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV4P43268 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms