Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2IP36954 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms