Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN2P35609 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN2P35609 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms